我國科學儀器工業經過30多年的發展，雖然已經一定開發和生產能力，但目前還面臨著一些問題：儀器的性能指標和穩定性、可靠性差；國家對科學儀器研究開發的投入不夠；沒有形成儀器開發同生產結合的機技術優勢?？茖W儀器設備產業是典型的國家戰略性產業，需要長期計劃和連續積累，不斷更新，這已經成了國內的共識。但這不是一個簡單的、可以在短時間內解決的問題，很多事情我們在思考的時候也許得有一個過程，這一研究也需要科研大環境的配合。
　　
　　科學儀器研究和創新不可能是某一個單位在短時間能完成的工作，難度恰恰來自于極端專業性，研制的不同階段應當是不同專業的單位來領頭才合適。
　　
　　選擇最初的領頭單位，最佳的選擇是選科學研究水平最高的，實際能做真正的高端儀器的單位,它的科研能力應處于國際頂端，至少持平或者接近國際頂級水平。因為很多高端儀器檢測的材料或者相關測試數據本身是高端儀器設計和數據庫參照的基準。
　　
　　例如，對于納米材料微觀檢測來說，如果納米材料的制備技術掌握得不好，單純依靠設備和器件設計出儀器，這只是一個空架子。因此，首先需要有標準樣品和測試數據，以此作為材料的標準和基準數據庫的理論和軟件，才有實質意義。
　　
　　高端儀器測試應用本身是尖端領域，實際獲得準確真實的標準和數據庫，是需要有高水平的前期專業研究作為鋪墊的，而且還需要有長期積累，甚至數十年的積累才行。
　　
　　有了這樣的積累后，領頭單位就可以換為以器件研發和設備制造為主的專業單位。這正體現了術業有專攻的道理。
　　
　　所以，首先，科學儀器創新計劃按照30到50年來制定可能更合適，不是一個五年計劃可以完成的。其次，高端儀器研制應當讓科研積累深厚和研究水平高的單位牽頭，其他單位配合。
　　
　　而現實是，國內對科研經費饑不擇食的單位很多，而不是理性地開始，以真正高水平的研究來確定領頭單位。實際上，配合單位在這件事上長期來看并不是被動的，因為高端儀器的制造是“鐵路警察各管一段”，高度專業化協作的過程，前期是一個艱苦積累培養發育的過程，真正收獲和得益的卻是后面的配套單位，每個階段應當是不同的專業單位領頭，有一個先后次序的邏輯關系。
　　
　　而國內的科研經費分配還沒有完全回歸理性，大家一哄而上，有的是包打天下，以為自己無所不能，而沒有看到這個工作需要高度專業的科學分工才可以完成。把前期經費多用在作基礎工作的研究上，后期經費主要給設備和器件制造，這需要有責任心和公正心，科學安排分配經費，而不是由著大家“饑不擇食”地去爭搶經費。
　　
　　還有的單位固守自己的技術，因為利益不愿共享，這是導致國內這一領域始終遲滯不前的根本原因。實際上這需要制度的保障，儀器研發后的利益收獲應該讓各個專業共享，才可以真正打通這一產業鏈。